הטיפולים במערכת העיכול בשיטת פאולה נעשים בלבוש מלא וללא מגע כפי שנעשים טיפולים בנושאים אחרים. התרגול כולל תרגילי
כיווץ והרפיה במקומות שונים בגוף ולאו דוקא במקומות הבעיתיים זאת משום שהגוף מפעיל מעצמו את האזור שדורש טיפול ויש יתרונות רבים להפעלה העקיפה. תרגילים שיעזרו במיוחד לבעיות מערכת העיכול יהיו: תנועה בכפות הידיים, כפות הרגליים והעיניים. המטפל מכוון לכיווצים והרפיות דרך תנועות דומות לפתיחה ואגרוף, או לכיווץ ועזיבה. כל אלו מזמנים לגוף העלאה של
יכולת ההתכווצות הכללית של מערכת העיכול. לפעמים כאב, עצירות, טחורים, פיסורה ושאר תופעות לא
נעימות מקורם בתנועתיות חלקית או ב"מעיים עצלים" מושג המכוון לפעילות איטית ולא יציבה של
המעיים וכלל המערכת. לכיווצים של השרירים הטבעתיים הרצוניים יש יכולת להשפיע על שיפור ההתכווצות של האברים הפנימיים ולכן יכולה השיטה להיות יעילה בטיפול בבעיות עיכול.
